k-means
算法 当数据是以流的方式到达的时候,我们可能想动态的估计(estimate
)聚类的簇,通过新的到达的数据来更新聚类。spark.mllib
支持流式k-means
聚类,并且可以通过参数控制估计衰减(decay
)(或“健忘”(forgetfulness
))。
这个算法使用一般地小批量更新规则来更新簇。
k-means
算法原理对每批新到的数据,我们首先将点分配给距离它们最近的簇,然后计算新的数据中心,最后更新每一个簇。使用的公式如下所示:
在上面的公式中,\(c_{t}\)表示前一个簇中心,\(n_{t}\)表示分配给这个簇的点的数量,
\(x_{t}\)表示从当前批数据的簇中心,\(m_{t}\)表示当前批数据的点数量。
当评价新的数据时,把衰减因子alpha
当做折扣加权应用到当前的点上,用以衡量当前预测的簇的贡献度量。当alpha
等于1时,所有的批数据赋予相同的权重,当alpha
等于0时,数据中心点完全通过当前数据确定。
衰减因子alpha
也可以通过halfLife
参数联合时间单元(time unit
)来确定,时间单元可以是一批数据也可以是一个数据点。假如数据从t
时刻到来并定义了halfLife
为h
,
在t+h
时刻,应用到t
时刻的数据的折扣(discount
)为0.5。
流式k-means
算法的步骤如下所示:
(1)分配新的数据点到离其最近的簇;
(2)根据时间单元(time unit
)计算折扣(discount
)值,并更新簇权重;
(3)应用更新规则;
(4)应用更新规则后,有些簇可能消失了,那么切分最大的簇为两个簇。
k-means
算法源码分析 在分步骤分析源码之前,我们先了解一下StreamingKMeans
参数表达的含义。
class StreamingKMeans(
var k: Int, //簇个数
var decayFactor: Double,//衰减因子
var timeUnit: String //时间单元
)
在上述定义中,k
表示我们要聚类的个数,decayFactor
表示衰减因子,用于计算折扣,timeUnit
表示时间单元,时间单元既可以是一批数据(StreamingKMeans.BATCHES
)也可以是单条数据(StreamingKMeans.POINTS
)。
由于我们处理的是流式数据,所以我们在流式数据来之前要先初始化模型。有两种初始化模型的方法,一种是直接指定初始化中心点及簇权重,一种是随机初始化中心点以及簇权重。
//直接初始化中心点及簇权重
def setInitialCenters(centers: Array[Vector], weights: Array[Double]): this.type = {
model = new StreamingKMeansModel(centers, weights)
this
}
//随机初始化中心点以及簇权重
def setRandomCenters(dim: Int, weight: Double, seed: Long = Utils.random.nextLong): this.type = {
val random = new XORShiftRandom(seed)
val centers = Array.fill(k)(Vectors.dense(Array.fill(dim)(random.nextGaussian())))
val weights = Array.fill(k)(weight)
model = new StreamingKMeansModel(centers, weights)
this
}
初始化中心点以及簇权重之后,对于新到的流数据,我们使用更新规则修改中心点和权重,调整聚类情况。更新过程在update
方法中实现,下面我们分步骤分析该方法。
//选择离数据点最近的簇
val closest = data.map(point => (this.predict(point), (point, 1L)))
def predict(point: Vector): Int = {
//返回和给定点相隔最近的中心
KMeans.findClosest(clusterCentersWithNorm, new VectorWithNorm(point))._1
}
// 获得更新的簇的向量和以及点数量
val mergeContribs: ((Vector, Long), (Vector, Long)) => (Vector, Long) = (p1, p2) => {
// y += a * x,向量相加
BLAS.axpy(1.0, p2._1, p1._1)
(p1._1, p1._2 + p2._2)
}
val pointStats: Array[(Int, (Vector, Long))] = closest
.aggregateByKey((Vectors.zeros(dim), 0L))(mergeContribs, mergeContribs)
.collect()
// 折扣
val discount = timeUnit match {
case StreamingKMeans.BATCHES => decayFactor
case StreamingKMeans.POINTS =>
//所有新增点的数量和
val numNewPoints = pointStats.view.map { case (_, (_, n)) =>
n
}.sum
// x^y
math.pow(decayFactor, numNewPoints)
}
//将折扣应用到权重上
//x = a * x
BLAS.scal(discount, Vectors.dense(clusterWeights))
上面的代码更加时间单元的不同获得不同的折扣值。当时间单元为StreamingKMeans.BATCHES
时,折扣就为衰减因子;当时间单元为StreamingKMeans.POINTS
时,折扣由新增数据点的个数n
和衰减因子decay
共同决定。
折扣值为n
个decay
相乘。
// 实现更新规则
pointStats.foreach { case (label, (sum, count)) =>
//获取中心点
val centroid = clusterCenters(label)
//更新权重
val updatedWeight = clusterWeights(label) + count
val lambda = count / math.max(updatedWeight, 1e-16)
clusterWeights(label) = updatedWeight
//x = a * x,即(1-lambda)*centroid
BLAS.scal(1.0 - lambda, centroid)
// y += a * x,即centroid +=sum*lambda/count
BLAS.axpy(lambda / count, sum, centroid)
}
上面的代码对每一个簇,首先更新簇的权重,权重值为原有的权重加上新增数据点的个数。然后计算lambda
,通过lambda
更新中心点。lambda
为新增数据的个数和更新权重的商。
假设更新之前的中心点为c1
,更新之后的中心点为c2
,那么c2=(1-lambda)*c1+sum/count
,其中sum/count
为所有点的平均值。
val weightsWithIndex = clusterWeights.view.zipWithIndex
//获取权重值最大的簇
val (maxWeight, largest) = weightsWithIndex.maxBy(_._1)
//获取权重值最小的簇
val (minWeight, smallest) = weightsWithIndex.minBy(_._1)
//判断权重最小的簇是否过小,如果过小,就将这两个簇重新划分为两个新的簇,权重为两者的均值
if (minWeight < 1e-8 * maxWeight) {
logInfo(s"Cluster $smallest is dying. Split the largest cluster $largest into two.")
val weight = (maxWeight + minWeight) / 2.0
clusterWeights(largest) = weight
clusterWeights(smallest) = weight
val largestClusterCenter = clusterCenters(largest)
val smallestClusterCenter = clusterCenters(smallest)
var j = 0
while (j < dim) {
val x = largestClusterCenter(j)
val p = 1e-14 * math.max(math.abs(x), 1.0)
largestClusterCenter.toBreeze(j) = x + p
smallestClusterCenter.toBreeze(j) = x - p
j += 1
}
}